L'EMSI offre une formation en 5ans après le BAC, dans les filières et options suivantes :
- Filière Ingénierie Informatique et Réseaux :
Option Système & Réseaux
Option MIAGE (Méthodes Informatiques Appliquées à la Gestion des Entreprises)
- Filière Ingénierie des Réseaux et Télécommunications
- Filière Génie Civil, Bâtiment et Travaux Publics
- Filière Génie Industriel
- Filière Ingénierie des Automatismes et Informatique Industrielle :
Option Automatismes Industriels
Option Informatique Industrielle
- Filière Ingénierie Financière et Audit